Francisco Maldonado (Salamanca, 1480 – Villalar, 1521) fue un noble y militar que dirigió las milicias salmantinas en la Guerra de las Comunidades de Castilla contra la política imperial de Carlos V. Condujo un ejército salmantino compuesto por 200 hombres a caballo y 6000 peones, a ayudar al comunero Juan de Padilla y al obispo Antonio de Acuña, venciendo el 21 de febrero de 1521 a Francés de Beaumont, realista refugiado en Torrelobatón, apresándolo pero respetando su vida.

Sin embargo, los refuerzos que el Condestable de Castilla trajo al ejército real, junto con errores propios, provocaron la derrota de los comuneros en Villalar el 23 de abril.

La madrugada del 24, Juan de Padilla, Juan Bravo y Francisco Maldonado fueron ejecutados tras un simulacro de juicio.